Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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BECN1Q14457 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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BECN1Q14457 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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BECN1Q14457 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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BECN1Q14457 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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BECN1Q14457 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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