Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms