Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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