Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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