Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL28Q13084 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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