Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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