Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTP4A2Q12974 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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