Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXF2Q12947 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXF2Q12947 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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FOXF2Q12947 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXF2Q12947 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXF2Q12947 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXF2Q12947 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXF2Q12947 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXF2Q12947 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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FOXF2Q12947 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXF2Q12947 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXF2Q12947 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXF2Q12947 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF2Q12947 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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