Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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