Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms