Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3AQ05086 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms