Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RELAQ04206 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RELAQ04206 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms