Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms