Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms