Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NHLH2Q02577 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms