Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms