Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms