Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms