Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM3AP98173 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM3AP98173 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM3AP98173 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM3AP98173 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM3AP98173 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM3AP98173 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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