Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms