Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms