Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UFM1P61960 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms