Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms