Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP9P55211 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms