Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUCLG1P53597 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms