Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDST1P52848 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NDST1P52848 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NDST1P52848 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDST1P52848 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDST1P52848 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDST1P52848 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDST1P52848 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms