Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms