Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT6CP48668 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms