Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACADSBP45954 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms