Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAEP38570 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms