Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms