Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms