Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA3P35244 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA3P35244 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA3P35244 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms