Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms