Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APEX1P27695 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX1P27695 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms