Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIFP27352 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIFP27352 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms