Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PLNP26678 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PLNP26678 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms