Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA3P25788 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMA3P25788 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms