Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms