Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEPDP12955 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEPDP12955 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEPDP12955 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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