Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DMDP11532 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DMDP11532 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DMDP11532 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DMDP11532 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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