Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI3P10071 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI3P10071 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI3P10071 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms