Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGB3P05106 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms