Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms