Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms