Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMDSO60547 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMDSO60547 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMDSO60547 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms