Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMC8O43402 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMC8O43402 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMC8O43402 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMC8O43402 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EMC8O43402 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMC8O43402 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMC8O43402 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMC8O43402 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMC8O43402 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms