Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-12■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 PRMT7-211ENST00000563608 626 ntTSL 513.6□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.222e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.3
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PRPF4O43172 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.096e-8■■□□□ 12.3
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PRPF4O43172 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.166e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.386e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.926e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.63e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.432e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 515.92■□□□□ 0.142e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.268e-9■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SRC-206ENST00000472968 461 ntTSL 316.4■□□□□ 0.223e-7■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 PTOV1-207ENST00000596424 625 ntTSL 217.45■□□□□ 0.382e-8■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 MLXIPL-210ENST00000476404 1921 ntTSL 216.44■□□□□ 0.228e-8■■□□□ 12.3
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PRPF4O43172 MCRIP2-203ENST00000491999 1050 ntTSL 522.5■■□□□ 1.192e-6■■□□□ 12.3
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PRPF4O43172 MCRIP2-206ENST00000615744 1379 ntTSL 317.75■□□□□ 0.432e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 MCRIP2-205ENST00000611328 628 ntTSL 314.56□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.771e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-6■■□□□ 12.3
PRPF4O43172 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.511e-6■■□□□ 12.3
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