Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms