Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms